Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms