Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms