Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms