Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
1700024B05RikE9Q6D7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700024B05RikE9Q6D7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms