Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc85cE9Q6B2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc85cE9Q6B2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85cE9Q6B2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85cE9Q6B2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85cE9Q6B2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85cE9Q6B2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85cE9Q6B2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85cE9Q6B2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85cE9Q6B2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc85cE9Q6B2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc85cE9Q6B2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms