Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FancfE9Q5Z5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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