Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930579F01RikE9Q3L6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms