Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc171E9Q1U1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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