Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms