Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Ddx60E9PZQ1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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Ddx60E9PZQ1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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