Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms