Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brd1E9PZ26 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms