Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rsph10bE9PYQ0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms