Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sptbn4E9PX29 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sptbn4E9PX29 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sptbn4E9PX29 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sptbn4E9PX29 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sptbn4E9PX29 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sptbn4E9PX29 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptbn4E9PX29 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptbn4E9PX29 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptbn4E9PX29 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptbn4E9PX29 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptbn4E9PX29 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sptbn4E9PX29 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms