Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms