Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc144bE9PVZ3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms