Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms