Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trim12cD3Z3L3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim12cD3Z3L3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms