Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms