Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms