Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc170D3YXL0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms