Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30cD3YVI9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30cD3YVI9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30cD3YVI9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30cD3YVI9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30cD3YVI9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30cD3YVI9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim30cD3YVI9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim30cD3YVI9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim30cD3YVI9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim30cD3YVI9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim30cD3YVI9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim30cD3YVI9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim30cD3YVI9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim30cD3YVI9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim30cD3YVI9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 778.3 ms