Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms