Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms