Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cttnbp2B9EJA2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms