Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6133B2RY53 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6133B2RY53 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms