Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cyp26c1B2RXA7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms