Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5483B2RV77 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5483B2RV77 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms