Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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