Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Apba1B2RUJ5 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms