Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Prrt4B2RU40 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Prrt4B2RU40 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Prrt4B2RU40 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Prrt4B2RU40 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Prrt4B2RU40 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Prrt4B2RU40 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Prrt4B2RU40 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Prrt4B2RU40 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Prrt4B2RU40 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Prrt4B2RU40 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Prrt4B2RU40 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt4B2RU40 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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