Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms