Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud4B2RRE7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms