Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms