Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mbd5B1AYB6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms