Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a6B1AVK5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col4a6B1AVK5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms