Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spocd1B1ASB6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms