Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn8B1ARD8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms