Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp8b5A3FIN4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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