Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Palm3A2TJV2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms