Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms