Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms