Protein–RNA interactions for Protein: A2ARP9

Catsper2, Cation channel sperm-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper2A2ARP9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Catsper2A2ARP9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Catsper2A2ARP9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Catsper2A2ARP9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Catsper2A2ARP9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Catsper2A2ARP9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Catsper2A2ARP9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Catsper2A2ARP9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Catsper2A2ARP9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Catsper2A2ARP9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsper2A2ARP9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms