Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms