Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms