Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c4A2ANA3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms