Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FocadA2AKG8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms