Protein–RNA interactions for Protein: A2AJX4

Malrd1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malrd1A2AJX4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Malrd1A2AJX4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Malrd1A2AJX4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Malrd1A2AJX4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Malrd1A2AJX4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Malrd1A2AJX4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Malrd1A2AJX4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Malrd1A2AJX4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Malrd1A2AJX4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Malrd1A2AJX4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Malrd1A2AJX4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Malrd1A2AJX4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Malrd1A2AJX4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Malrd1A2AJX4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Malrd1A2AJX4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Malrd1A2AJX4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Malrd1A2AJX4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Malrd1A2AJX4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Malrd1A2AJX4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Malrd1A2AJX4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Malrd1A2AJX4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Malrd1A2AJX4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms