Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc183A2AJB1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc183A2AJB1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms