Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms